Scooby-Doo, mystères associés

Dans la ville de Crystal Cove, de nombreux phénomènes paranormaux (Fantômes, Monstres...) se produisent, l'endroit est même devenue un point d'attraction pour touriste, ces activités sont une source de revenues pour la ville, Fred, Sammy, Véra, Daphné et leur chien Scooby-Doo forment un groupe d'adolescent qui résout les énigmes lié à ces phénomènes, ces derniers sont convaincus que ces phénomènes ne sont pas réel et qu'ils sont souvent causé par des individus, une pratique qui n'est pas bien vue par leur parents et par les autorités du coins car elle gêne plus les activités touristiques qu'autres choses. C'est sans compter l'aide d'un certain "Mr. E" qui communique aux héros des indices qui pourraient être lié aux phénomènes qui se produisent à Crystal Cove.